Prírodovedecká fakulta bola založená v roku 1963. Štúdium na fakulte pozostáva z dvoch stupňov - bakalárskeho a magisterského. Po absolvovaní bakalárskeho štúdia môžu študenti pokračovať v magisterskom štúdiu alebo štúdium na fakulte ukončiť s titulom Bakalár (Bc.). Štandardná dĺžka magisterskeho stupňa štúdia je 5 rokov a končí sa udelením titulu Magister (Mgr.). Od školského roku 1998/99 je štúdium realizované na báze kreditného systému v súlade s Európskym štandardom ECTS.
Fakulta tiež umožňuje štúdium pre zahraničných študentov.
Na fakulte je v súčastnosti vybudovaných sedem odborov - biológia, enviromentálna ekológia, fyzika, geografia, chémia, informatika a matematika, ktoré sa študujú buď samostatne, alebo v aprobácii dvoch akademických odborov. Absolventi dvojodborového štúdia sa uplatňujú ako učitelia na všetkých typoch stredných a základných škôl.
Doktorandské štúdium predstavuje tretí stupeň vysokoškolského vzdelávania. Prírodovedecká fakulta má akreditáciu v následejúcich odboroch doktorandského štúdia: Diskrétna matematika, Teória vyučovania matematiky, Fyzika kondenzovaných látok a akustika, Jadrová a subjadrová fyzika, Biofyzika, Teória vyučovania fyziky, Anorganická chémia, Organická chémia, Analytická chémia, Biochémia, Genetika, Fyziológia živočíchov a Programové a informačné systémy.

• Virtuálna kolaborácia
• Nazeranie na zrod času
• Pohľad do mikrosveta
• Kľúče poznania
• Experiment "ATLAS"
• WEB Univerzita

• Mesto Košice
• Univerzita P. J. Šafárika
• Prírodovedecká fakulta
• Ústav experimentálnej fyziky SAV, Košice